使用3D-Analyze方法：

1. 下载并安装3D-Analyze工具。

2. 启动3D-Analyze并选择游戏执行文件：

打开3D-Analyze，点击“选择程序”或“Select”。

在游戏安装目录中找到游戏的exe文件（通常是PAL3.exe），选择后确认。

3. 设置窗口模式：

在“性能”（Performance）一栏，选择“强制窗口模式”（force windowed mode）。

在“硬件限制”（Hardware Limits）一栏，选择“模拟DXT纹理压缩”（emulate DXT textures）。

4. 运行游戏：

点击“运行程序”（RUN），游戏将以窗口模式启动。

使用D3DWindower方法：

1. 运行D3DWindower.exe。

2. 选择游戏执行文件：

在菜单中选择“选择仙剑三问情篇游戏执行档PAL3.exe”。

3. 设置游戏：

左键点击PAL3图标，然后右键选择“设置”。

在弹出对话框中，点击“辅助DLL”后的“打开”，选择D3dHook.dll。

转到“输入设备”标签，勾选“钩住DirectInput”以及“鼠标位置修正”相关选项。

4. 运行游戏：

关闭设置对话框，左键点击PAL3图标，右键选择“运行”，或者直接双击图标来启动游戏。

注意事项：

窗口化后，尽量避免最小化游戏窗口或切换到桌面，以防游戏出现问题。

若需最大化窗口，可以在游戏运行后，将窗口拖到最大，这样可以避免误操作导致窗口最小化。

以上这些方法，无论是使用3D-Analyze还是D3DWindower，都可以帮助你更方便地在窗口模式下运行《仙剑奇侠传3》，让你在享受游戏的也能轻松查阅攻略或其他资料。希望这些信息能够帮助你解决问题！